Возникший в окружении живописных озер Аукштайтии поселок Висагинас (ранее - Снечкус) своими масштабами и ритмом роста обязан строительству здесь Игналинской атомной электростанции (АЭС).

После того, как в 1990 году Висагинас посетил владыка Хризостом, в поселке атомщиков зарегистрировалась первая православная община. Для удовлетворения нужд местных верующих сюда из Вильнюса время от времени стали приезжать священники, которые совершали богослужения в актовом зале местного технического училища и там же крестили народ. Но были верующие, испытывавшие нужду в постоянном духовном общении и молитве. Они собирались на частных квартирах, читали Псалтирь, Акафисты, пели. Весной 1991 года в общину был направлен постоянный пастырь о. Иосиф Зетеишвили.

А затем в одном из строящихся жилых микрарайонов поселка администрация АЭС выделила православной общине помещение для молельного дома. Это была так называемая «вставка» - небольшое красного кирпича здание между многоэтажными домами.

Первое богослужение, состоявшееся 7 июля 1991 года в уже готовом помещении церкви, совпало с праздником Рождества Иоанна Предтечи. Люди невольно думали об особом участии в духовной жизни их поселка святого Крестителя Господня. И через год по благославению владыки Хризостома церковь официально получила имя Пророка Иоанна.

Живой источник веры вдохновлял людей прихода на христианские дела милосердия. В благотворительности нуждались многие, оставшиеся без работы и крова люди. На помощь обездоленным пришла супружеская чета висагинских прихожан Кирилловых – Галина и Федор. Они стали опекать беспризорных ребятишек, делясь с ними всем, что Бог пошлет.

Сестричество собирало, а затем распределяло среди малоимущих одежду, школьные принадлежности, постельное белье. К благотворительной миссии присоединились и работники АЭС. В церкви бедняки получали хлеб, молоко, а то и горячие обеды. Прихожане делились с ними овощами со своих огородов.

На Рождество и Пасху в храме для всех устраивались бесплатные обеды, раздавались подарки и билеты на городские мероприятия. Сестричество устраивало акции помощи детям-сиротам Зарасайского дома опеки. Поныне в Предтеченском приходе продолжается миссия благотворительности, начатая более десяти лет назад сестричеством «Вера, Надежда, Любовь». Около сотни сирот и детей из бедных семей каждый понедельник получают питание в храме. В этот день им предлагают и кое-что из одежды, принесенной по зову церкви сердобольными людьми. По понедельникам приезжают к храму и бедняки из окрестных селений. На Пасху и Рождество обездоленным раздают праздничные продовольственные пакеты – сахар, растительное масло, яйца, молоко, муку, яблоки и куличи.

В июле 1997 года, юбилейного для нашей епархии года, когда отмечались сразу две даты: 650-летие кончины свв. Виленских мучентков и 400-летие вильнюсского Свято-Духова монастыря, - висагинцы совершили Крестный ход в столицу Литвы. Во всех святых местах на пути следования через Зарасай- Утяну- Швянченис совершались богослужения и читались акафисты. Паломники шли с Крестом, иконами – взрослые и дети, предводительствуемые нынешним настоятелем Висагинского храма Рождества Иоанна Предтечи Георгием Саломатовым. Висагинских богомольцев везде принимали радушно. Четыре дня пути к вильнюсской обители увенчались радостной встречей с Патриархом Московским и всея Руси Алексием II, возглавлявшим богослужения в монастырском соборе. С тех пор паломничества к свв. Виленским мученикам стали для висагинцев традиционными.

15 сентября 2000 года по определению митрополита Виленского и Литовского Хризостома настоятелем Храма Рождества Иоанна Крестителя назначается иерей Георгий Саломатов. Свое пастырское служение он начинал как раз в этом храме, а затем окормлял приходы в Зарасай, Рокишкис, Утяне. При о. Георгии община взяла на себя труд обновления родного Дома молитвы. Начать решили с укладки нового паркета в алтаре, затем пришлось отбивать лакированные покрытия церковных стен, заново их отштукатуривать. Для улучшения акустики молельного зала строители закругляли углы потолка. Вместе с профессиональными рабочими трудились и прихожане. Старожилы вспоминают: тогда богослужения в храме проводились с шести утра, чтобы к восьми часам уступить «рабочую площадку» строителям.

Ремонт длился почти два года при материальной поддержке епархии, АЭС и городского самоуправления. Обновленный Предтеченский храм визуально как бы расширился и посветлел. Появились новые иконы на клиросе: Спаса Вседержителя и Богородицы Сионской, святителя Николая Чудотворца и целителя великомученика Пантелеимона, все они написаны прихожанкой-художницей Ольгой Кириченко. Простой иконостас украсился затейливым узором, старательно вырезанным на фанере Игнатом Саломатовым. После ремонта в нижнем этаже храма разместились: свечной ящик с духовной литературой, иконками, аудио- и видеокассетами, а также библиотека, где всегда можно получить совет о книге на нужную вам тему. Есть и трапезная, где после литургии проходят занятия воскресной школы. Здесь же по вторникам и пятницам о. Георгий ведет внебогослужебные беседы с прихожанами.

Среди русских Висагинаса никогда не было недостатка в музыкально одаренных любителях пения. Наверное, поэтому в Предтеченском храме сформировалось несколько хоров. Детским руководит педагог местной музыкальной школы. Ребята поют на богослужениях, а кроме того, готовят программы для праздничных утренников. Обычно они проходят в просторных городских залах и всегда умеют успех. Есть при храме молодежный хор. Вначале его регентом была Виктория Саломатова, которая обучалась церковному музыкальному искусству в Дивееве. Три года в молитве и послушании провела Виктория в одном из скитов этой прославленной обители.

Церковный праздничный хор под управлением Ирины Захаренко – это профессиональный коллектив педагогов местной музыкальной школы. Он остался в Предтеченском храме и после разделения общины. Праздничный хор часто выступает в городских концертах, на международных фестивалях сакральной музыки, знакомя самую широкую аудиторию с красотой звучания православных песнопений. В 2000 году хористами записаны диски с исполнением духовных произведений Д. Бортнянского, А. Архангельского, П. Чайковского, а также распевов Валаамского и Киевского монастырей. Службы в церкви в честь Рождества Иоанна Предтечи совершаются во вторник (день Иоанна Предтечи), в четверг или пятницу, по субботам и воскресным дням, и , конечно, в Двунадесятые и Великие праздники. Счастливая возможность у висагинских верующих – за каждым богослужением молиться в сопровождении такого разнообразия хоров, певческих школ и стилей!

Следить за чистотой в храме – это тоже дело мирян. По понедельникам в Предтеченской церкви – генеральная уборка, ответственная за неё бывшая хирургическая сестра, прихожанка Светлана Аристова.

Долгое время церкви приходилось платить государству налоги за аренду помещения и землю, на которой оно находится. Представлялось маловероятным, что здание храма передадут в собственность православным. Но ситуация недавно разрешилась чудесным образом. За символическую плату приход получил права на церковное здание.